Родился 14 августа 1945 года в селе Аромашево Тюменской области. По окончании десяти классов местной средней школы поступил в Омское высшее общевойсковое командное училище.
Путь офицера начался с Группы советских войск в Германии. После обучения в Военной Академии имени М.В.Фрунзе служба продолжилась в Московском военном округе.
В августе 1982 года подполковник Бородин прибыл в Республику Афганистан на должность советника командира 38 бригады специального назначения «Коммандос» Вооруженных Сил южной страны. В её составе участвовал в боевых действиях против незаконных отрядов оппозиции. За проявленное мужество удостоен афганского ордена «Звезда» III степени. Правительством СССР награжден орденом Красного Знамени. Вышестоящим командованием отмечен присвоением очередного звания полковник.
Михаил Иванович пропал без вести (по свидетельству сослуживцев — погиб) 16 мая 1983 года в ходе ожесточенного боя у населенного пункта Ургун провинции Пактия.
Его имя высечено на мраморной плите монумента погибшим в Афганистане воинам-интернационалистам Тюменской области, ХМАО-Югры, ЯНАО мемориального комплекса павшим защитникам Отечества в сквере Губкина столицы региона — города Тюмени (интернет-портал журнала «Смоленск»: «Восстание в Бадабере: в поисках истины»).