Родился 17 октября 1969 года в Северо-Казахстанской области Казахстана. Там окончил десять классов школы села Покровка.
Оттуда в ноябре 1987 года призвался в армию. Служба началась с войсковой части города Аягуз (теперь — Аягоз) Казахстана, Среднеазиатский военный округ. В марте 1988 года на базе части сформировали 1476 отдельный автомобильный батальон.
Новосформированный автобат передали в подчинение штаба Краснознаменного Туркестанского военного округа и передислоцировали в Республику Афганистан, поселение Шинданд провинции Герат (присвоено наименование — в/ч пп 35802).
В составе автоколонн 0017, 0018, 0019 доставляли продукты, боеприпасы, топливо по юго-западной местности страны. Особо опасная дорога проходила через «зелёнку» перед населенным пунктом Кандагар. На обратном пути вывозили имущество воинских гарнизонов: начинался первый этап вывода советских войск.
За выполнение интернационального долга младший сержант Хрипунков награжден медалью «От благодарного афганского народа», знаком «Воину – интернационалисту».
Вернулся на Родину в конце января 1989 года. Дослужил положенный срок на территории СССР. В ноябре 1989 года уволился в запас. В 1990-х переехал на постоянное место жительства в Тюмень. В декабре 2023 года Сергей Александрович подписал контракт с Министерством Обороны РФ и убыл в район Специальной Военной Операции. Принимал участие в освобождении города Авдеевки Донецкой Народной Республики. Погиб 27 июня 2024 года. Похоронен на Аллее Славы Червишевского кладбища города Тюмени.